根据微波介质加热原理，微波加热具有从材料内部产生，加热速度快、穿透深度深，能选择性加热，操作控制方便等特点，因此在农副产品的干燥、杀虫、杀菌等方面显示了其他方法难以竞争的优点，得到较广泛的应用。实践证明：利用微波可以在较短的时间内，或在较低的温度下，在物料的内部和表面同时得到常规方法难以达到的杀虫或杀菌效果。 微波干燥设备能在加压成型后迅速脱去水分，节能低耗，省时省力 降低了劳动强度，无污染新型干燥设备
1、产品干燥定型质量好，不开裂，干燥均匀。
2、易于控制，操作方便、灵活；由于微波输出功率可调，输送带速度可调，配备耐热传输带链板，所以适合不同材质的产品都可以使用。
3、节省时间，产量高，能源消耗少；通过厂家实际生产，干燥时间是红外干燥的1/5，节省能源1/3。
4、生产强度小，省力、省工序，特别是易于和前后工序连成自动生产线，减少搬运次数；节省人力,劳动效率大大提高。
5、环保清洁卫生，无污染，更不会产生“三废"问题。 现在隧道式智能微波设备还可以应用到杀虫方面。
1、杀虫：日本东芝公司首先利用微波对塌塌米（一种草垫）进行工业的杀虫处理获得成功。当塌塌米温度上升到60℃左右时，其内部的害虫和虫卵均已杀灭。浙江黄岩一些厂家的实践也证明利用微波进行杀虫、杀菌，防止霉变具有良好的效果。国外在微波杀虫方面进行了大量的研究，实践证明当农产品本身温度达到55℃-60℃时，其成虫、幼虫、蛹和虫卵已全部杀灭。
2、杀菌：微波杀菌在食品工业中早已得到应用，1976年据日本东芝公司统计，该公司生产用于糕点、米面等食品杀菌的微波功率容量已占其工业微波总量的34％，我国也早在七十年代就对中药材、粮食等进行灭菌、北京军事医学院用于实验动物饲料和垫料的处理，安徽商业科技研究所对荔枝干进行防霉处理不仅省工省时效率高，且保持了食品原有的品质和口感均收到良好效果。国内外研究证明，利用微波均匀加热至70--80℃时，时间保持1～2分钟，可以使一般的肠道菌、酵母菌和霉菌基本杀灭，但杀灭原生孢子必须在121--130℃温度下保持3-4分钟。
3、酶的灭活：在食品和农产品的加工中，经常会遇到需对某些酶灭活处理的问题。例如从成熟谷粒轧制成的面粉，其α的活性很强，必须灭活处理。否则作出来的面包内部发韧，如用在其它方面（作粘接剂、加厚剂、填充剂）也是有问题的。欧洲国家生产小麦。因其α淀粉的活性特别强，更迫切需要使酶灭活，常用的方法是加热面粉至远高于64℃，这将导致面粉中水分丧失，还需要重新处理。但利用微波仅需加热几十秒，就能使酶的活性降低到允许的程度，还可杀死面粉中的大量微生物，又不影响面粉的主要特性。 微波干设备自动进料系统经过蛟龙提升机将瓜子送到进料仓然后通过料斗的狼牙棒转动将瓜子分拨到传输带上进入微波加热箱加热熟化。还适用于炒货领域大批量的各种干果类。如：核桃、板栗、杏仁、开心果、核桃仁、葵花子、西瓜子、南瓜子、无壳瓜子、花生、榛子、香榧、果仁等焙炒、膨化。其特点：物料在微波电磁场的直接作用下，均匀加热，无需经过热传导。卫生、高效，膨化效果好于常规工艺。同时在微波的热效应和非热效应的双重作用下具有杀菌功效。与传统工艺相比，生产环境好，没有热惯性，产品酥脆爽口，香味浓郁，膨化率高，色泽自然，营养成分损失少。
